荧光显微镜
SymPhoTime 64
荧光寿命成像和相关分析软件
- 功能强大的64位数据采集和分析软件
- 单点，2D，和3D的TTTR数据采集，包含有可在线预览FLIM，FCS，time trace和TCSPC数据的功能
- FLIM、快速FLIM和FLIM-FRET
- FCS、FCCS、FLCS、PIE-FCS，符合相关，总相关分析
- FRET、PIE-FRET
- 荧光随时间的分析及单分子荧光爆发现象分析
- 各向异性分析
- TCSPC寿命拟合，包括先进的误差分析
- 基于"STUPSLANG"语言的用户自定义编译脚本功能
SymPhoTime 64是一款集数据采集和分析为一身的软件，它被用来控制MicroTime 200，MicroTime 100，及LSM升级系统这三种显微共聚焦系统，和其他TCSPC设备。该软件需要在64位操作系统下工作，拥有简单易懂的用户操作界面。结构清晰，功能强大，使用户可以更高效的获取数据分析结果，并可以通过Workspace模式更加直观的管理数据。最后，通过基于"STUPSLANG"语言的用户自定义编译脚本功能，用户可以任意改变分析和测量的具体步骤。
使用PicoQuant TCSPC模块测量数据
SymPhoTime 64专门为与PicoQuant时间分辨共聚焦显微系统联用而设计，例如MicroTime 200，MicroTime 100以及LSM升级系统。同时，还可以与各种基于PicoQuant TCSPC设备搭建的自建系统联用。SymPhoTime 64软件具有独特的时间标记模式，在这个模式下，每个通道探测到的所有光子的绝对抵达时间都被记录，这样，基于这样详尽的数据信息，用户可以进行从简单的TCSPC柱状图分析，到复杂的寿命成像和相关分析。
专业化的成像分析
使用SymPhoTime 64分析成像数据，简单而有效。其操作界面包含有许多标准的成像分析模块，例如FLIM，FRET和各向异性分析。用户可以根据分析需求选择对应的专业数据分析方向，从而得到准确的数据。
超快的软件相关器
SymPhoTime 64在荧光相关光谱方面有专门的分析模块。这些围绕相关分析的拟合模块包括：经典的自相关荧光相关光谱(FCS)，互相关光谱(FCCS)和总相关分析。而通过时间标记模式，符合相关的分析也是可以做到的。得益于当前多核处理器的强大性能，SymPhoTime 64是当前最快的软件相关器。
强度Time trace分析
荧光强度Time trace分析是SymPhoTime 64另一项主要功能。荧光强度Time trace包含有荧光动态学信息，可以从多方面进行分析，例如ON/OFF柱状图分析，爆发量柱状图，以及荧光寿命Trace分析。
STED超分辨
SymPhoTime 64支持基于MicroTime 200的超分辨STED系统。不同的数据采集功能以及STED专用激光的操作界面都集成到了SPT 64中。在数据采集的同时，STED成像和时间 - 门控下的gSTED图像可以在线显示。图片后续处理模块，包括gSTED和Pattern Matching可以被用来进一步提升STED分辨率。软件同时还具有STED - FCS功能。
软件版本
该软件目前有5种版本，每种对应不同的需求：
- SPT64 1A "SymPhoTime 64": 支持单点测量
- SPT64 1 "SymPhoTime 64": 支持单点测量及数据分析
- SPT64 2 "SymPhoTime 64": 支持2D和3D数据采集及分析
- SPT64 1+2 "SymPhoTime 64": 完整版
- SPT64 1+2+3 "SymPhoTime 64": STED版完整版
当前软件版本：2.4
最新的软件版本支持MultiHarp 150，高速FLIM，以及来自PI的E727压电平移台，C867大范围平移台。软件由特殊的USB加密狗保护，在加密狗接入电脑并且能被正确识别时，软件才能运作。
|
数据采集 |
|
|
可联用TCSPC模块 |
HydraHarp 400, PicoHarp 300, TimeHarp 260, MultiHarp 150，TimeHarp 200 (仅数据导入) |
|
可联用荧光系统 |
MicroTime 200
激光扫描显微系统 (LSM)，支持Nikon, Olympus或 Zeiss品牌 |
|
探测通道数量 |
1 到 8 detectors |
|
采集模式 |
单点采集，多点采集，2D成像(XY，XZ，YZ)，3D成像(XYZ)，定时成像(XYT)，用于调节系统时使用的示波器模式 |
|
采集预览 |
FLIM, FCS, FLCS 和FCCS, Time Trace, TCSPC柱状图 |
|
自动化测量 |
Z轴逐层成像, 定时成像, 图片缝合, 多点测量 |
|
硬件控制 |
PDL 828 "Sepia II" 激光驱动器
MicroTime 200的快门系统 |
|
数据分析 |
|
|
总体特点 |
时间门控
TCSPC binning 最小平方拟合, 最大可能性估算拟合, IRF解卷积拟合，尾部拟合，自举误差分析 TCSPC曲线的全局化分析 图形化交互界面 |
|
成像 |
FLIM, FLIM-FRET, 荧光强度FRET, 各向异性成像, (时间门控) 荧光强度成像
Pattern Matching, 快速Pattern Matching 用于相位分析的Bin输出（通过荧光动力学实验室开发的第三方软件Globals） |
|
相关分析 |
FCS, FCCS, FLCS, PIE–FCS |
|
FRET |
PIE (脉冲交错激发) |
|
STED |
STED, 门控STED, STED-FLIM, 交错脉冲 STED及共聚焦, 分辨率估计 |
|
荧光强度Trace |
分子闪烁(On/Off 柱状图), 计数率柱状图 (PCH), 爆发量柱状图, 强度门控制TCSPC, 荧光寿命 Traces, 寿命柱状图, BIFL |
|
稳态各向异性 |
包含物镜校正系数 |
|
导出数据格式 |
BMP, ASCII, TIFF, BIN |
|
用户自定义脚本译 (STUPSLANG) |
用户自定分析步骤, 拟合功能, 多条件筛选 |
荧光寿命成像和相关分析软件SymPhoTime 64可以被用于时间分辨共聚焦数据采集实验，如：
- 时间分辨荧光
- 荧光寿命成像(FLIM)
- 磷光寿命成像(PLIM)
- 荧光相关光谱(FCS)
- 荧光寿命相关光谱(FLCS)
- 荧光共振能量转移(FRET)
- 超分辨显微(STED)
- 双聚焦荧光相关光谱(2fFCS)
- 脉冲交错激发(PIE)
- 单分子探测/光谱学
- Pattern Matching分析
- 时间分辨磷光(TRPL)
- TRPL成像
- 镧化物上转换
- 反聚束
Version features
|
SPT64 1A |
SPT64 1 |
SPT64 2 |
SPT64 1+2 |
SPT64 1+2+3 |
|
|
数据采集 |
|||||
|
直接通过 TimeHarp 260, PicoHarp 300或 HydraHarp 400采集TTTR数据 |
|
|
 |
|
|
|
控制Physik Instrumente平移台 |
|
|
|
|
|
|
对激光扫描显微镜 (LSM)的支持及其他扫描台联用 |
|
|
|
|
|
|
STED成像, STED-FLIM, STED-FCS |
|
|
|
|
|
|
路由多通道支持 |
|
|
|
|
|
|
多单点采集 |
|
|
|
|
|
|
数据分析 |
|||||
|
时间门控功能 |
|
|
|
|
|
|
TCSPC寿命柱状图拟合(最高5阶指数) 包括尾部拟合,解卷积拟合分析,最大相似估计法及自举误差分析 |
|
|
|
|
|
|
荧光寿命成像 (FLIM) 包括在线成像,特定区域分析,最大相似估计法和bitmap格式导出 |
|
|
|
|
|
|
Pattern Matching,快速Pattern Matching |
|
|
|
|
|
|
荧光相关光谱 (FCS) 包括脉冲交错激发模式,及带有自举误差分析法的FCS拟合 |
|
|
|
|
|
|
荧光寿命相关光谱 (FLCS) |
|
|
|
|
|
|
实时FCS计算和Time Trace显示 ("在线 time traces", "在线-FCS") |
|
|
|
|
|
|
总相关 |
|
|
|
|
|
|
荧光共振能量转移 (FRET) 包括脉冲交错激发(PIE),及直接激发和渗滤校正 |
|
|
|
|
|
|
STED成像, STED FLIM,门控STED,脉冲交错 STED和共聚焦,分辨率估算 |
|
|
|
|
|
|
多通道复用分析 –寿命和强度 time traces |
|
|
|
|
|
|
BIFL分析 |
|
|
|
|
|
|
On/Off时间柱状图及分析 |
|
|
|
|
|
|
爆发量柱状图 |
|
|
|
|
|
|
PCH光子计数柱状图的计算 |
|
|
|
|
|
|
ASCII格式数据导出 |
|
|
|
|
|
|
脚本编译("STUPSLANG") |
|
|
|
|
|
Latest 10 publications referencing MicroTime 200, LSM Upgrade Kit, MicroTime 100, SymPhoTime
The following list is an extract of 10 recent publications from our bibliography that either bear reference or are releated to this product in some way. Do you miss your publication? If yes, we will be happy to include it in our bibliography. Please send an e-mail to info@picoquant.com containing the appropriate citation. Thank you very much in advance for your kind co-operation.
DDX3X and DDX3Y constitutively form nano-sized RNA-protein clusters that foster enzymatic activity
Yanas A., Shweta H., Owens M.C., Liu K.F., Goldman Y.E.
bioRxiv, preprint (2025)
Reference to: MicroTime 200, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), HydraHarp 400, SPADs
Breaking the low concentration barrier of single-molecule fluorescence quantification to the sub-picomolar range
Veedu M.K., Wenger J.
Optics (2025)
Reference to: Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), HydraHarp 400, SymPhoTime
Related to: FCS
Characterization and structural basis for the brightness of mCLIFY: a novel monomeric and circularly permuted bright yellow fluorescent protein
Shweta H., Gupta K., Zhou Y., Cui X., Li S., Lu Z., Goldman Y.E., Dantzig J.A.
Research Square, preprint (2024)
Reference to: MicroTime 200, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series), SymPhoTime
Related to: FLIM, FRET
Plasmon mediated single photon emission from a nanocrystal ensemble
Mondal P., Saha S.K., Roy P., Vasudeva N., Anshu A., Rajasekar G.P., Pandey A.
The Journal of Physical Chemistry Letters, Vol.015, p.7556-7565 (2024)
Reference to: MicroTime 200
In-situ post-synthetic treatment of CsPbBr3 perovskite nanocrystals in nanoporous silica microspheres
Tatarinov D.A., Xie J., Qian Q., Wang Q., Maslova N.A., Borodina L.N., Litvin A.P., Huang H.
Chinese Journal of Chemistry, Vol.042, p.2779-2787 (2024)
Reference to: MicroTime 100
Functionalization of fibrous substrates with mesoporous silica nanoparticles as a strategy to obtain Photodynamic antibacterial textiles
da Silva A.C.P., Arruda L.M., Moreira I.P., Scacchetti F.A.P., de Oliveira H.P.M., Samulewski R.B., Fangueiro R., Ressaro A.L.
Dyes and Pigments, Vol.230, 112342 (2024)
Reference to: MicroTime 200, FluoTime 300
Single-point substitution F97M leads to in cellulo crystallization of the biphotochromic protein moxSAASoti
Marynich N.K, Boyko K.M, Matyuta I.O, Minyaev M.E, Khadiyatova A.A, Popov V.O, Savitsky A.P.
Biochemical and Biophysical Research Communications, Vol.732, 150419 (2024)
Reference to: MicroTime 200, SymPhoTime
Identification an suppression of point defects in bromide perovskite single crystals enabling gamma-ray spectroscopy
Ni Z., Zhao L., Shi Z., Singh A., Wiktor J., Liedke M.O., Wagner A., Dong Y., Beard M.C., Keeble D.J., Huang J.
Advanced Materials, Vol.036, 2406193 (2024)
Reference to: TimeHarp 260, MicroTime 100
CsPbBr3 perovskite crack platelet nanocrystals and their biexciton generation
Bera S., Tripathi A., Titus T., Sethi N.M., Das R., Afreen, Adarsh K.V., Thomas K.G., Pradhan N.
Journal of the American Chemical Society, Vol.146, p.20300-20311 (2024)
Reference to: MicroTime 200, Pulsed Diode Lasers (PDL Series, LDH-Series, LDH-FA Series)
Quantitative comparison of recombination rates of core/shell quantum dots in colloidal solutions and self-assembled monolayer superlattices
Brinn R.M., Yan C., Abbas A.S., Ondry J., Alivisatos A.P.
The Journal of Physical Chemistry C., Vol.128, p.12131-12140 (2024)
Reference to: MicroTime 200
The following documents are available for download:
- Brochure about the SymPhoTime 64 software
- Pattern matching analysis using SymPhoTime 64
- Practical Manual for Fluorescence Microscopy Techniques
Presentations (as PDF files)
The following step-by-step tutorials for the SymPhoTime 64 are available at http://www.tcspc.com
- Script registration
- Focal width determination
- Calibrate the confocal volume using the FCS calibration script
- TCSPC fitting script
- Lifetime fitting using the FLIM script
- Lifetime separation using the FLCS script
- Using the intensity time trace script
- Caluclate and fit FCS traces with the FCS script
- Calculate FCCS traces with the grouped FCS script
- Using the FLCS script for spectral crosstalk removal via FLCS
- ROI-fitting using the FLIM script
- Visualizing dynamics using the multi frame FLIM script
- Pattern matching
- FLIM-FRET calculation for multi-exponential donors
- FLIM-FRET calculation for single-exponential donors
- Calculate ratiometric FRET images with the FRET image script
- Single-pair FRET distributions using the FRET script
- Single-pair FRET distributions using the PIE-FRET script
- Using the anisotropy image script
- Using the antibunching script